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Facultad de CienciasFacultad de Ciencias

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Personal Docente e Investigador (P.D.I.). Listado general.

Aguirre de C?rcer Garc?a, Daniel

Aguirre de Cárcer García, Daniel

Profesor Ayudante Doctor
Área de conocimiento:
Genética
Despacho:
B106
Email:
daniel.aguirre@uam.es
Teléfono:
91 497 8249
Fax:
91 497 8344
Página personal>
Resumen curriculum vitae

Mi tesis doctoral se centró en la caracterización de las interacciones planta-microorganismo y estructura de la comunidad en suelos contaminados. Posteriormente realicé una estancia postdoctoral de 3 años en Australia para estudiar el microbioma intestinal humano. De vuelta en España, me centré en el estudio de diversos enfoques de metagenómica y secuenciación masiva, antes de obtener una Marie Curie International Incoming Fellowship que me dio la posibilidad de estudiar la diversidad genética de las comunidades virales y microbianas en ambientes lacustres polares mediante técnicas metagenómicas. En la actualidad soy Profesor Ayudante Doctor en la unidad de Genética.

Investigación

Lineas de investigación

Línea 1 de Genética: Metagenómica


Resumen de línea: Acercamientos metagenómicos y bioinformáticos para el esclarecimiento de la estructura y función del Microbioma
Palabras clave de línea: 16S, Ecología Microbiana Molecular, Metagenómica, Bioinformática, Microbioma,
Profesores/Investigadores implicados en esta línea de investigación: Daniel Aguirre de Cárcer.

Línea 2 de Genética: Especiación y “zonas híbridas”


Resumen de línea: Mecanismos genéticos y evolutivos implicados en los procesos de especiación, fundamentalmente a través del estudio de una “zona híbrida”.
Palabras clave de línea: Genética Evolutiva, Especiación, Zonas Híbridas.
Profesores/Investigadores implicados en esta línea de investigación: Begoña Fernández Calvín, Joaquina de la Torre Escudero, José Martín Martín, Miguel Pita, Daniel Aguirre de Cárcer, José Luis Bella.

 

Línea 3 de Genética: Wolbachia


Resumen de línea: Se estudia el papel de este endosimbionte obligado bacteriano como barrera reproductiva y agente involucrado en la divergencia genética y la especiación.

Palabras clave de línea: Genética evolutiva, Wolbachia, especiación.

Profesores/Investigadores implicados en esta línea de investigación: Daniel Aguirre de Cárcer, Begoña Fernández Calvín, José Martín Martín, José Luis Bella.

Publicaciones

Aguirre de Cárcer D, López-Bueno A, Pierce D, Alcamí A (2014) Biodiversity and Distribution of Polar Freshwater Viruses. Science Advances 1, e1400127.

 

Aguirre de Cárcer D, Angly F, Alcamí A (2014) Evaluation of viral genome assembly and diversity estimation in deep metagenomes. BMC Genomics 15, 989.

 

Dray S, Pavoine S, Aguirre de Cárcer D (2014) Considering external information to improve the phylogenetic comparison of microbial communities: a new approach based on constrained Double Principal Coordinates Analysis (cDPCoA). Mol Ecol Resour. doi: 10.1111/1755-09.

 

Aguirre de Cárcer D, Cuív PO, Wang T, Kang S, Worthley D, Whitehall V, Gordon I, McSweeney C, Leggett B, Morrison M (2011) Numerical ecology validates a biogeographical distribution and gender-based effect on mucosa-associated bacteria along the human colon. ISME J.  5, 801-9.

 

Aguirre de Cárcer D, Martín M, Mackova M, Macek T, Karlson U, Rivilla R (2007) The Introduction of Genetically Modified Microorganisms Designed for Rhizoremediation Induces Changes on Native Bacteria in the Rhizosphere but not in the Surrounding Soil. ISME J. 1, 215-23.

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