En la Facultad de Ciencias Económicas y Empresariales se han constituido 28 Grupos de Investigación oficialmente reconocidos por la Universidad Autónoma de Madrid (Estatutos de la UAM, Artículo 112.1). Dichos grupos han sido promovidos por la Universidad al amparo del artículo 40.2 de la Ley Orgánica de Universidades (LOU), que los define como "unidades básicas para la realización de la investigación".
La investigación se lleva a cabo también, y sin perjuicio de la libre iniciativa individual, en el ámbito de grupos de investigación, que han sido promovidos por la UAM con el doble fin de aunar esfuerzas en torno a determinados temas de interés y de facilitar la comunicación entre los investigadores, la comunidad científica y la sociedad en general. En la Facultad de Ciencias Económicas y Empresariales existen actualmente los siguientes grupos:
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