La Fundación disponde de una oficina en la Universidad Autónoma de Madrid, ubicada en el Módulo C-XVI de la Facultad de Ciencias, en la que se coordinan las actividades de formación y específicamente el Máster en Espacios Naturales Protegidos, cuyas clases se imparten mayoritariamente también en el campus de la Autónoma. Esta oficina, con dos puestos de trabajo, apoya también las actividades generales de la Fundación en sus vertientes de publicaciones y otras formas de difusión, organización de encuentros y seminarios y coordinación con el Centro de Documentación de Espacios Naturales ubicado en la Biblioteca de Ciencias de la UAM.
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El acceso desde Madrid al campus se realiza por la carretera de Colmenar Viejo M-607. Existe un servicio de autobuses directos, a través de la línea 714, con salida en Madrid en el nivel -1 del intercambiador de transportes de la Plaza de Castilla.
La estación de cercanías Cantoblanco-Universidad está situada en el propio campus, comunicando la universidad con Madrid a través de la línea C-4. Los trenes, con dirección Tres Cantos, Colmenar o Alcobendas-San Sebastián de los Reyes, pueden tomarse en Atocha, Nuevos Ministerios, Chamartín y el resto de estaciones de las líneas citadas.