Gestión de socio-ecosistemas
Gran parte de mi investigación ha estado y sigue centrada, no sólo en la teoría sino también en la práctica de la gestión de los sistemas socio-ecológicos. Trabajo bajo el marco conceptual y metodológico de la Ciencia de la Sostenibilidad una nueva aproximación transdisciplinaria que se centra en explorar las interacciones complejas que se establecen entre los sistemas naturales y los sistemas humanos. Constituye una ciencia cívica, integrada e integradora. En definitiva una ciencia con conciencia de los problemas socio-ecológicos y por tanto comprometida con su solución.
- Durante varios años he trabajado con la administración ambiental regional de la Junta de Andalucía a través de su Consejería de Medio Ambiente en diferentes proyectos y planes de gestión de gran envergadura y repercusión.
He sido coordinador científico del Programa de Investigación (PICOVER) que suministró la información científica interdisciplinaria necesaria para el desarrollo del Proyecto de restauración ecológica del Corredor Verde del Guadiamar desarrollado por la Junta de Andalucía después de la crisis socioecológica generada en 1998 por el vertido minero de Aznalcóllar. Los libros más relevantes generados por el proyecto fueron

1999.
La Estrategia del Corredor Verde del Guadiamar. Fundamentos (existe versión en ingles)
-2000 El Programa de Investigación del Corredor Verde del Guadiamar Integrando Investigación, Conservación y Desarrollo.
- 2001. Corredor Verde del Guadiamar Abril 1998-Abril 2001.
- 2002. Fuentes documentales de la cuenca del Guadiamar-
-2003. Ciencia y Restauración del Rio Guadiamar
- 2003. Corredor Verde del Guadiamar. Del desastre ecológico a la declaración de un nuevo espacio natural protegido (existe versión en ingles)
- 2008. La restauración ecológica del río Guadiamar y el Proyecto del Corredor Verde. Historia de un paisaje emergente.
Estos documentos pueden obtenerse del Fondo Editorial Digital de la Consejeria de Medio Ambiente
- He sido el coordinador científico del Plan Andaluz de Humedales
2004. Plan Andaluz de Humedales
- He sido coordinador científico del Proyecto sobre El Plan Director de la Red de Espacios Naturales de Andalucía (RENPA).
-2003. Vínculos en el paisaje mediterráneo. El papel de los espacios protegidos en el territorio
- He sido asesor científico y miembro del Grupo de Expertos que elaboraron los Fundamentos y la Estrategia del Programa para garantizar la sostenibilidad ambiental en América Latina Araucaria XXI.
2005. Fundamentos Araucaria XXI
2005 Programa Araucaria XXI
- He sido coordinador científico del Plan de Manejo del Parque Nacional Galápagos del que tengo el honor de ser Guadaparque Honorario.
2005 Plan de Manejo. Parque Nacional Galápagos.
2007 Una visión de futuro para Galápagos. El Plan de Manejo para todos
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En la actualidad: En Galápagos desarrollamos dos Proyectos interdisciplinarios Uno financiado por la UAM-Grupo Banco de Santander sobre nuevas estrategias y prioridades para la conservación de la biodiversidad y el desarrollo humano en el archipiélago, en el marco del cambio global y la teoría de los sistemas complejos adaptativos. En el proyecto participan las Universidades Andina Simón Bolívar y San Francisco de Quito, la Fundación Charles Darwin y el Parque Nacional Galápagos y otro Financiado por el Programa de Cooperación Interuniversitaria e Investigación Científica entre España e Iberoamerica titulado Ciencia para la sostenibilidad en galápagos: diseño de una estrategia y agenda de investigación para la conservación de la biodiversidad y el desarrollo sostenible del archipiélago desde la integración de las ciencias sociales y las ciencias biofísicas
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En Colombia desarrollamos un Proyecto sobre resiliencia del sistema socio-ecológico de la Cienaga Grande de Santa Marta junto con la Universidad del Magdalena.
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En Costa Rica estoy como asesor científico de los Proyectos Gestión Socio-ecológica del Territorio como un enfoque de conservación para el desarrollo y del
Proyecto integral Río Frío-Río San Juan (Costa Rica-Nicaragua). Los proyectos están financiados y coordinados por la Agencia Española de Cooperación Internacional y desarrollados por el Sistema Nacional de Áreas de Conservación de Costa Rica (SINAC) y el Instituto Nacional de Biodiversidad (INBIO).