La Facultad de Ciencias se organiza en torno a 16 Departamentos: Biología, Biología Molecular, Ecología, Física Aplicada, Física Materiales, Física de la Materia Condensada, Física Teórica de la Materia Condensada, Física Teórica, Geología y Geoquímica, Matemáticas, Química, Química Agrícola, Química Analítica y Análisis Instrumental, Química Física Aplicada, Química Inorgánica, Química Orgánica, ubicados en tres edificios dentro del Campus de Cantoblanco: Edificio de Ciencias, Edificio de Biología y Edificio de Ingeniería Química y Ciencias de la Alimentación, en estos edificios además de las aulas, laboratorios y salas de estudio se ofrecen espacios de encuentro como los locales de las Asociaciones de Estudiantes, salas polivalentes, salones de grado, salas de conferencias, salón de actos y cafeterías, un entorno en el que se promueve la formación universitaria integral.
La Universidad ofrece unas estupendas instalaciones deportivas, variadas actividades culturales, y un Servicio de Idiomas con una amplia y variada oferta; desde la Facultad de Ciencias se apoyan las Asociaciones de Estudiantes con las más diversas inquietudes, a lo que hay que añadir la promoción de valores y compromiso voluntario desde la Oficina de Acción Solidaria y desde la Oficina de Ecocampus se suscita la participación en la gestión ambiental de la universidad.
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